MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica OSU18 chromosome

Total Repeats: 34217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008369	A	8	8	24	31	100 %	0 %	0 %	0 %	115313982
2	NC_008369	A	9	9	33	41	100 %	0 %	0 %	0 %	115313982
3	NC_008369	A	6	6	136	141	100 %	0 %	0 %	0 %	115313982
4	NC_008369	CAA	2	6	176	181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115313982
5	NC_008369	ATT	2	6	208	213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313982
6	NC_008369	TAA	2	6	222	227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115313982
7	NC_008369	A	6	6	226	231	100 %	0 %	0 %	0 %	115313982
8	NC_008369	A	6	6	242	247	100 %	0 %	0 %	0 %	115313982
9	NC_008369	T	7	7	282	288	0 %	100 %	0 %	0 %	115313982
10	NC_008369	CAA	2	6	293	298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115313982
11	NC_008369	AGA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115313982
12	NC_008369	AGT	2	6	333	338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313982
13	NC_008369	TCA	2	6	385	390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115313982
14	NC_008369	AGA	2	6	435	440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115313982
15	NC_008369	TGT	2	6	495	500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115313982
16	NC_008369	AGC	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115313982
17	NC_008369	TGG	2	6	585	590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115313982
18	NC_008369	GCAA	2	8	618	625	50 %	0 %	25 %	25 %	115313982
19	NC_008369	ATT	2	6	664	669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313982
20	NC_008369	TTA	2	6	689	694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313982
21	NC_008369	CAAGAT	2	12	721	732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	115313982
22	NC_008369	TGAT	2	8	770	777	25 %	50 %	25 %	0 %	115313982
23	NC_008369	GAA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115313982
24	NC_008369	A	6	6	994	999	100 %	0 %	0 %	0 %	115313982
25	NC_008369	CAG	2	6	1034	1039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115313982
26	NC_008369	GTAC	2	8	1057	1064	25 %	25 %	25 %	25 %	115313982
27	NC_008369	TAC	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115313982
28	NC_008369	CTA	2	6	1133	1138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115313982
29	NC_008369	GCTT	2	8	1153	1160	0 %	50 %	25 %	25 %	115313982
30	NC_008369	AAGAA	2	10	1181	1190	80 %	0 %	20 %	0 %	115313982
31	NC_008369	ATA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115313982
32	NC_008369	GTT	2	6	1216	1221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115313982
33	NC_008369	AAG	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115313982
34	NC_008369	TGG	2	6	1359	1364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115313982
35	NC_008369	ATGC	2	8	1384	1391	25 %	25 %	25 %	25 %	115313982
36	NC_008369	GAT	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313982
37	NC_008369	TAAA	2	8	1474	1481	75 %	25 %	0 %	0 %	115313982
38	NC_008369	A	6	6	1508	1513	100 %	0 %	0 %	0 %	115313983
39	NC_008369	TAT	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313983
40	NC_008369	ATA	3	9	1625	1633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115313983
41	NC_008369	AGTT	2	8	1686	1693	25 %	50 %	25 %	0 %	115313983
42	NC_008369	TGAT	2	8	1769	1776	25 %	50 %	25 %	0 %	115313983
43	NC_008369	TAA	2	6	1812	1817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115313983
44	NC_008369	AGCA	2	8	1883	1890	50 %	0 %	25 %	25 %	115313983
45	NC_008369	CAA	2	6	1906	1911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115313983
46	NC_008369	TCA	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115313983
47	NC_008369	TAT	2	6	1923	1928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313983
48	NC_008369	ATG	2	6	1955	1960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313983
49	NC_008369	CTA	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115313983
50	NC_008369	A	7	7	2106	2112	100 %	0 %	0 %	0 %	115313983
51	NC_008369	AGA	2	6	2148	2153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115313983
52	NC_008369	ATA	2	6	2270	2275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115313983
53	NC_008369	ATT	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313983
54	NC_008369	TAA	2	6	2400	2405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115313983
55	NC_008369	GAA	2	6	2515	2520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115313983
56	NC_008369	TCTA	2	8	2527	2534	25 %	50 %	0 %	25 %	115313983
57	NC_008369	ATA	2	6	2579	2584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115313983
58	NC_008369	GTTT	2	8	2585	2592	0 %	75 %	25 %	0 %	115313983
59	NC_008369	ATT	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313983
60	NC_008369	TAT	2	6	3121	3126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313984
61	NC_008369	T	7	7	3142	3148	0 %	100 %	0 %	0 %	115313984
62	NC_008369	ATA	2	6	3205	3210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115313984
63	NC_008369	TAG	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313984
64	NC_008369	ATG	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313984
65	NC_008369	CAA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115313984
66	NC_008369	CTT	3	9	3417	3425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115313984
67	NC_008369	CATCT	2	10	3512	3521	20 %	40 %	0 %	40 %	115313984
68	NC_008369	TA	3	6	3563	3568	50 %	50 %	0 %	0 %	115313984
69	NC_008369	TTCTT	2	10	3584	3593	0 %	80 %	0 %	20 %	115313984
70	NC_008369	T	7	7	3612	3618	0 %	100 %	0 %	0 %	115313984
71	NC_008369	CTT	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115313984
72	NC_008369	CTT	2	6	3684	3689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115313984
73	NC_008369	GAT	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313984
74	NC_008369	TCAA	2	8	3734	3741	50 %	25 %	0 %	25 %	115313984
75	NC_008369	CAAC	2	8	3773	3780	50 %	0 %	0 %	50 %	115313984
76	NC_008369	CCTTG	2	10	3782	3791	0 %	40 %	20 %	40 %	115313984
77	NC_008369	AAC	2	6	3832	3837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115313984
78	NC_008369	A	6	6	3856	3861	100 %	0 %	0 %	0 %	115313984
79	NC_008369	CTT	2	6	3888	3893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115313984
80	NC_008369	ATTA	2	8	3901	3908	50 %	50 %	0 %	0 %	115313984
81	NC_008369	ATG	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313984
82	NC_008369	TTA	2	6	3945	3950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313985
83	NC_008369	TAG	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313985
84	NC_008369	GGT	2	6	4053	4058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115313985
85	NC_008369	TAC	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115313985
86	NC_008369	TGA	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313985
87	NC_008369	GAT	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313985
88	NC_008369	TTA	2	6	4210	4215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313985
89	NC_008369	CAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115313985
90	NC_008369	GT	3	6	4252	4257	0 %	50 %	50 %	0 %	115313985
91	NC_008369	TGA	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313985
92	NC_008369	ATT	2	6	4307	4312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313985
93	NC_008369	TGTT	2	8	4324	4331	0 %	75 %	25 %	0 %	115313985
94	NC_008369	GGTA	2	8	4334	4341	25 %	25 %	50 %	0 %	115313985
95	NC_008369	AT	3	6	4373	4378	50 %	50 %	0 %	0 %	115313985
96	NC_008369	AAT	2	6	4388	4393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115313985
97	NC_008369	GGT	2	6	4518	4523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115313985
98	NC_008369	T	6	6	4576	4581	0 %	100 %	0 %	0 %	115313985
99	NC_008369	TA	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	115313985
100	NC_008369	TAG	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313985
101	NC_008369	CAACA	2	10	6924	6933	60 %	0 %	0 %	40 %	115313986
102	NC_008369	TAAGAG	2	12	6969	6980	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115313986
103	NC_008369	GTTT	2	8	6989	6996	0 %	75 %	25 %	0 %	115313986
104	NC_008369	TAA	2	6	7004	7009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115313986
105	NC_008369	TAA	2	6	7085	7090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115313986
106	NC_008369	TGA	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313986
107	NC_008369	GA	3	6	7132	7137	50 %	0 %	50 %	0 %	115313986
108	NC_008369	TGA	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313986
109	NC_008369	TTG	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115313986
110	NC_008369	AAAT	2	8	7196	7203	75 %	25 %	0 %	0 %	115313986
111	NC_008369	AGG	2	6	7209	7214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115313986
112	NC_008369	TGA	2	6	7230	7235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313986
113	NC_008369	TATG	2	8	7284	7291	25 %	50 %	25 %	0 %	115313986
114	NC_008369	TGTA	2	8	7293	7300	25 %	50 %	25 %	0 %	115313986
115	NC_008369	TTA	2	6	7323	7328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313986
116	NC_008369	GCT	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115313986
117	NC_008369	TGGTTT	2	12	7401	7412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115313986
118	NC_008369	GA	3	6	7463	7468	50 %	0 %	50 %	0 %	115313986
119	NC_008369	TCA	2	6	7545	7550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115313986
120	NC_008369	ACA	2	6	7612	7617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115313986
121	NC_008369	TAA	2	6	7710	7715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115313986
122	NC_008369	TTG	2	6	7724	7729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115313986
123	NC_008369	T	6	6	7749	7754	0 %	100 %	0 %	0 %	115313986
124	NC_008369	CAG	2	6	7757	7762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115313986
125	NC_008369	TAT	2	6	7789	7794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313986
126	NC_008369	CT	3	6	7799	7804	0 %	50 %	0 %	50 %	115313986
127	NC_008369	TAT	2	6	7880	7885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115313987
128	NC_008369	CAA	2	6	7898	7903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115313987
129	NC_008369	GAA	2	6	7909	7914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115313987
130	NC_008369	A	7	7	7923	7929	100 %	0 %	0 %	0 %	115313987
131	NC_008369	TGG	2	6	7952	7957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115313987
132	NC_008369	TGG	2	6	7988	7993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115313987
133	NC_008369	TGA	2	6	8060	8065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313987
134	NC_008369	GAT	2	6	8151	8156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313987
135	NC_008369	GAT	2	6	8166	8171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115313987
136	NC_008369	CAG	2	6	8200	8205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115313987
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389	NC_008369	A	7	7	23795	23801	100 %	0 %	0 %	0 %	115313998
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